BioEdit軟件是一款為分子生物學科研人員提供的序列對比工具,這款軟件可以讓你在電腦上通過簡單的點擊操作查看和操作序列。這款軟件和同類工具DNAMAN 相比,其分析內容相對更豐富一些,并且提供了很多網絡程序的分析界面和接口。
BioEdit序列對比方法:
首先要把所有的序列復制到windows自帶的記事本中,全部以fasta格式存到同一個文件中,保存成*.txt,序列內部最好不要有空格或者換行。
序列格式舉例如下:
“>序列1
ATCG..........ATCG
>序列2
ATCG..........ATCG
>序列3
ATCG..........ATCG
>序列4
ATCG..........ATCG”
然后用Bioedit打開剛才保存的文件*.txt,點擊窗口上方的Accessory application菜單,再點擊clustelW multiple alignment,這時候會彈出一個窗口,直接選擇Run clustalW,又彈出一個窗口,選擇ok,等待結果就行了。
最后的比對結果可以保存成*.fas格式,適用于各種分析。
主要功能:
手對齊的幾種模式
自動化ClustalW對齊
自動爆炸搜索(本地和WWW)
質粒繪圖和注釋
附件應用程序配置
限制映射